Description du poste
Mission générale
L’entrepôt de données cliniques vise à remplir un certain nombre de missions autour de la numérisation des pratiques au sein du CHNO, du développement de la recherche clinique interne au CHNO, ainsi que de l’accélération des collaborations avec l’IdV dans le cadre de l’IHU. Il s’agira dans la pratique de la constitution de files actives de patients recrutables dans des essais cliniques, la constitution de cohortes, la réalisation d’études rétrospectives sur données de vie réelle collectées lors du soin dans l’établissement, et la collaboration sur des projets de recherche translationnelle avec les chercheurs de l’IdV et ses partenaires internationaux.
Le rôle du data scientist méthodologie/biostatistiques sera d’accompagner les chercheurs de l’hôpital et de l’institut de la vision dans leurs projets de recherche autour de l’entrepôt, de la conception méthodologique de l’étude à la réalisation des analyses statistiques, modélisations, figures et la remise d’un rapport en passant par l’extraction de données et leur mise en forme pour l’exploitation.
Le data scientist est compétent en méthodologie de la recherche, dans le traitement statistique des données médicales, et familier avec les systèmes d’information.
Missions permanentes
- Accompagnement méthodologique des projets de recherche sur l’entrepôt
- Extraction de données de l’entrepôt
- Data management des données extraites
- Analyses statistiques descriptives et comparatives, modélisation statistique
- Rédaction de rapports d’analyse
- Rédaction des parties méthode et résultats d’articles scientifiques
- Conception de tableaux de bords et visualisations
Autres détails
Profil recherché
COMPETENCES REQUISES
L'expérience particulière souhaitée
Titulaire d’un diplôme Bac+5 en data science, statistiques, biostatistiques avec expérience de 2 à 4 ans dans le secteur de la recherche bio-médicale et disposant de compétences dans les secteurs suivants :
Ø Méthodologie de la recherche scientifique et biomédicale
Ø Maîtrise de R / Python
Ø Data management
Ø Analyses descriptives
Ø Analyses comparatives, tests statistiques bivariées
Ø Modèles multivariés, modèles de survie
Ø Connaissance des nomenclatures médicales et des standards d’interopérabilité en santé (FHIR, OMOP, CIM10, CCAM, SNOMEDCT, LOINC, etc.)
Ø Expérience sur la méthodologie des essais adaptatifs
Ø Interrogation de bases de données SQL
Ø Familiarité avec les environnements UNIX/Linux
Maîtrise de l’anglais scientifique et médical
Description de l'établissement
Situé dans le 12ème arrondissement de Paris (Bastille), l’hôpital national de la vision des 15-20 est un établissement public de santé de ressort national spécialisé en ophtalmologie, reconnu internationalement dans le traitement des pathologies affectant la vision. Il assure l’ensemble des missions d’un hôpital universitaire (soins, enseignement, recherche et prévention) et propose, chaque année, une prise en charge d’excellence à près de 120 000 patients.
Structurée autour de quatre services hospitalo-universitaires d’ophtalmologie, l’organisation des 15-20 est entièrement tournée vers la prise en charge des maladies de l’œil et la pratique d’opérations chirurgicales (25 000 par an), dont 86% se font en ambulatoire.
L’offre de soins s’appuie sur trois centres spécialisés du glaucome, de la cornée (y compris chirurgie réfractive et kératocône) et de la rétine, qui complètent les consultations assurées par le centre des consultations d’ophtalmologie (CCO). Outre l’accueil de plus de 50 000 urgences ophtalmologiques 24h/24 et 7jours/7, l’hôpital propose ainsi une prise en charge de haut niveau de la majeure partie de la pathologie ophtalmologique, qu’elle soit médicale, chirurgicale ou neuro-ophtalmologique.
Présentation du service et de l'équipe :
Entièrement tourné vers l’ophtalmologie, le Centre Hospitalier National d’Ophtalmologie (CHNO) est devenu, au fil du temps, un véritable pôle de référence dans le traitement des pathologies de l’œil.
A cet effet, le centre hospitalier national comporte :
- Quatre services d’ophtalmologie disposant des équipements les plus performants et les plus récents,
- Un service d’anesthésiologie et un bloc opératoire de 8 salles,
Un service de médecine interne,
- Un service de neuro-imagerie (doté d'une IRM de dernière génération et d'un scanner à rayons X),
- Un laboratoire de biologie médical et d’anatomopathologie,
- Un service d’urgences,
- Une pharmacie hospitalière,
- Des consultations générales et spécialisées.
Dans le cadre de l’Institut Hospitalo-Universitaire (IHU) associant le CHNO, l’Institut de la Vision (IdV), l’INSERM, Sorbonne Université et la Fondation Voir et Entendre, le CHNO se dote d’un entrepôt de données cliniques sous la responsabilité d’un médecin spécialisé en informatique médicale.
Pour mener à bien ce projet, une équipe est constituée autour de ce responsable médical et comprendra :
- 1 ingénieur data
- 1 data scientist profil «Méthodologie et biostatistique»
- 1 data scientist profil «Machine learning et traitement de l’image»